Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
AlkP97793 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
AlkP97793 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
AlkP97793 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
AlkP97793 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
AlkP97793 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
AlkP97793 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
AlkP97793 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
AlkP97793 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
AlkP97793 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
AlkP97793 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
AlkP97793 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
AlkP97793 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
AlkP97793 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
AlkP97793 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
AlkP97793 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AlkP97793 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AlkP97793 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AlkP97793 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
AlkP97793 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AlkP97793 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
AlkP97793 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
AlkP97793 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
AlkP97793 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
AlkP97793 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AlkP97793 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AlkP97793 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AlkP97793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AlkP97793 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AlkP97793 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
AlkP97793 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
AlkP97793 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
AlkP97793 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
AlkP97793 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
AlkP97793 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
AlkP97793 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
AlkP97793 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
AlkP97793 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
AlkP97793 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
AlkP97793 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AlkP97793 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AlkP97793 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AlkP97793 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AlkP97793 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AlkP97793 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AlkP97793 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AlkP97793 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AlkP97793 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
AlkP97793 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AlkP97793 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AlkP97793 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AlkP97793 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
AlkP97793 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
AlkP97793 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AlkP97793 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
AlkP97793 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AlkP97793 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AlkP97793 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
AlkP97793 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AlkP97793 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AlkP97793 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms