Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited1P97769 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited1P97769 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cited1P97769 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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