Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfc1P97766 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfc1P97766 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfc1P97766 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms