Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LystP97412 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LystP97412 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LystP97412 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LystP97412 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LystP97412 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LystP97412 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LystP97412 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LystP97412 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LystP97412 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LystP97412 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LystP97412 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LystP97412 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LystP97412 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LystP97412 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LystP97412 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LystP97412 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LystP97412 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LystP97412 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LystP97412 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LystP97412 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LystP97412 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LystP97412 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LystP97412 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LystP97412 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LystP97412 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LystP97412 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LystP97412 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LystP97412 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LystP97412 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms