Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b3P97370 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atp1b3P97370 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b3P97370 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b3P97370 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1b3P97370 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms