Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc2P97363 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptlc2P97363 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptlc2P97363 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms