Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhodP97348 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhodP97348 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhodP97348 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhodP97348 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhodP97348 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhodP97348 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhodP97348 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhodP97348 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhodP97348 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhodP97348 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhodP97348 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhodP97348 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhodP97348 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhodP97348 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhodP97348 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms