Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl21bP86792 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl21bP86792 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl21bP86792 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms