Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43cP86449 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43cP86449 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43cP86449 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms