Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim43bP86448 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim43bP86448 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms