Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx2P81066 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx2P81066 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx2P81066 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms