Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1bP70700 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1bP70700 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms