Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp4P70343 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp4P70343 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp4P70343 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp4P70343 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casp4P70343 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp4P70343 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp4P70343 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp4P70343 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp4P70343 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp4P70343 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp4P70343 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms