Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb13P70321 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb13P70321 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb13P70321 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms