Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux2P70298 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cux2P70298 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux2P70298 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cux2P70298 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cux2P70298 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cux2P70298 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cux2P70298 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cux2P70298 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 502.7 ms