Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd13P70217 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd13P70217 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms