Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DccP70211 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DccP70211 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DccP70211 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DccP70211 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DccP70211 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DccP70211 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DccP70211 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DccP70211 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DccP70211 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DccP70211 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DccP70211 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DccP70211 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DccP70211 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DccP70211 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DccP70211 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DccP70211 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DccP70211 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DccP70211 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DccP70211 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DccP70211 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DccP70211 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DccP70211 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DccP70211 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DccP70211 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DccP70211 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DccP70211 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DccP70211 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DccP70211 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DccP70211 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DccP70211 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DccP70211 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DccP70211 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DccP70211 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DccP70211 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DccP70211 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DccP70211 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DccP70211 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DccP70211 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DccP70211 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DccP70211 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DccP70211 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DccP70211 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DccP70211 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DccP70211 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DccP70211 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DccP70211 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DccP70211 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DccP70211 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DccP70211 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DccP70211 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DccP70211 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DccP70211 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
DccP70211 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DccP70211 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DccP70211 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DccP70211 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DccP70211 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DccP70211 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DccP70211 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DccP70211 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DccP70211 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DccP70211 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DccP70211 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms