Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrig1P70193 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig1P70193 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms