Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SbdsP70122 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SbdsP70122 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SbdsP70122 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbdsP70122 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms