Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1P63239 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1P63239 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1P63239 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms