Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb1P63158 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb1P63158 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgb1P63158 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms