Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps27aP62983 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27aP62983 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms