Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl39P62892 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39P62892 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39P62892 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39P62892 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl39P62892 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl39P62892 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl39P62892 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms