Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl30P62889 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl30P62889 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms