Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbx1P62878 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms