Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra1P62812 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra1P62812 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms