Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrch1P62046 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch1P62046 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms