Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ufm1P61961 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufm1P61961 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms