Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abce1P61222 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abce1P61222 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abce1P61222 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms