Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif4a1P60843 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif4a1P60843 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Eif4a1P60843 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms