Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp1P60335 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcbp1P60335 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms