Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scarf2P59222 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scarf2P59222 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf2P59222 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms