Protein–RNA interactions for Protein: P59111

Kcnh8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnh8P59111 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnh8P59111 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnh8P59111 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kcnh8P59111 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnh8P59111 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms