Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp3P59055 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csrnp3P59055 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Csrnp3P59055 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Csrnp3P59055 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms