Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripk2P58801 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ripk2P58801 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ripk2P58801 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripk2P58801 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripk2P58801 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripk2P58801 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripk2P58801 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms