Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Strn4P58404 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Strn4P58404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Strn4P58404 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Strn4P58404 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Strn4P58404 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms