Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp20P57748 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp20P57748 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms