Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TdgP56581 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TdgP56581 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TdgP56581 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TdgP56581 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TdgP56581 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TdgP56581 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TdgP56581 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TdgP56581 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TdgP56581 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TdgP56581 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TdgP56581 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TdgP56581 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TdgP56581 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TdgP56581 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TdgP56581 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TdgP56581 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TdgP56581 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TdgP56581 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TdgP56581 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TdgP56581 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TdgP56581 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TdgP56581 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TdgP56581 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TdgP56581 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TdgP56581 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TdgP56581 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TdgP56581 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TdgP56581 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TdgP56581 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TdgP56581 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TdgP56581 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TdgP56581 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TdgP56581 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms