Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox17P56394 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox17P56394 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox17P56394 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms