Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5g3P56384 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5g3P56384 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms