Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4aP56371 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms