Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd3P55096 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd3P55096 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms