Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rad23bP54728 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad23bP54728 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms