Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtbP53612 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms