Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ApodP51910 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ApodP51910 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApodP51910 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApodP51910 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApodP51910 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApodP51910 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApodP51910 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApodP51910 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApodP51910 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ApodP51910 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApodP51910 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApodP51910 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ApodP51910 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ApodP51910 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApodP51910 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApodP51910 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ApodP51910 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ApodP51910 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApodP51910 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ApodP51910 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms