Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec1P51908 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec1P51908 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms