Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr5P51682 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr5P51682 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms