Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CastP51125 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CastP51125 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CastP51125 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CastP51125 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CastP51125 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CastP51125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CastP51125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CastP51125 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CastP51125 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CastP51125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CastP51125 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CastP51125 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CastP51125 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CastP51125 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CastP51125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CastP51125 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CastP51125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CastP51125 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CastP51125 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CastP51125 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CastP51125 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CastP51125 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CastP51125 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CastP51125 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CastP51125 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CastP51125 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CastP51125 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CastP51125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CastP51125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CastP51125 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CastP51125 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CastP51125 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CastP51125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CastP51125 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CastP51125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CastP51125 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CastP51125 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CastP51125 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CastP51125 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CastP51125 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CastP51125 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CastP51125 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CastP51125 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CastP51125 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CastP51125 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CastP51125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CastP51125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CastP51125 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CastP51125 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CastP51125 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1574.9 ms