Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc13P50207 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc13P50207 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms