Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtshP49935 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtshP49935 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtshP49935 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtshP49935 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtshP49935 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtshP49935 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtshP49935 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtshP49935 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtshP49935 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtshP49935 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtshP49935 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtshP49935 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtshP49935 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtshP49935 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtshP49935 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtshP49935 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtshP49935 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtshP49935 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtshP49935 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtshP49935 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtshP49935 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtshP49935 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtshP49935 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtshP49935 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtshP49935 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtshP49935 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtshP49935 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtshP49935 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtshP49935 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtshP49935 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtshP49935 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtshP49935 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtshP49935 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtshP49935 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtshP49935 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtshP49935 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtshP49935 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtshP49935 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtshP49935 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtshP49935 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtshP49935 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtshP49935 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtshP49935 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms